MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56E

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017488	TAT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829556
2	NC_017488	GAAA	2	8	138	145	75 %	0 %	25 %	0 %	385829556
3	NC_017488	AG	3	6	150	155	50 %	0 %	50 %	0 %	385829556
4	NC_017488	A	8	8	200	207	100 %	0 %	0 %	0 %	385829556
5	NC_017488	TAG	2	6	225	230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829556
6	NC_017488	A	6	6	259	264	100 %	0 %	0 %	0 %	385829556
7	NC_017488	TA	4	8	279	286	50 %	50 %	0 %	0 %	385829556
8	NC_017488	AT	3	6	443	448	50 %	50 %	0 %	0 %	385829556
9	NC_017488	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	385829556
10	NC_017488	TA	3	6	496	501	50 %	50 %	0 %	0 %	385829556
11	NC_017488	TGA	2	6	507	512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829556
12	NC_017488	A	6	6	518	523	100 %	0 %	0 %	0 %	385829556
13	NC_017488	GAA	2	6	531	536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829556
14	NC_017488	ATG	2	6	638	643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829556
15	NC_017488	CAA	2	6	659	664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829556
16	NC_017488	ACAA	2	8	765	772	75 %	0 %	0 %	25 %	385829556
17	NC_017488	A	7	7	806	812	100 %	0 %	0 %	0 %	385829557
18	NC_017488	ACA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829557
19	NC_017488	GAG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385829557
20	NC_017488	ATT	2	6	900	905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829557
21	NC_017488	AATA	2	8	907	914	75 %	25 %	0 %	0 %	385829557
22	NC_017488	A	7	7	2119	2125	100 %	0 %	0 %	0 %	385829558
23	NC_017488	A	6	6	2158	2163	100 %	0 %	0 %	0 %	385829558
24	NC_017488	GCG	2	6	2209	2214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385829558
25	NC_017488	AGA	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829558
26	NC_017488	A	8	8	2252	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	385829558

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.